Pusat Studi Jepang Universitas Indonesia (PSJ UI) Indonesia dibentuk sejak tanggal 10 Februari 1995 berdasarkan Surat Keputusan Rektor Universitas Indonesia nomor 022/SK/R/UI/1995 dan diresmikan pada tanggal 2 Juni 1995 oleh Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia Prof. Dr. Wardiman Djojonegoro. Kantor PSJ terletak di Gedung Pusat Studi Jepang Universitas Indonesia berlokasi di kampus UI Depok.

Berdasarkan Keputusan Rektor Universitas Indonesia nomor 2063/SK/R/UI/2048 tanggal 27 Agustus 2018, Pusat Studi Jepang Universitas Indonesia (PSJ UI) ditetapkan sebagai Unit Kerja Khusus Pelayanan dan Pengabdian Masyarakat Universitas Indonesia (UKK PPM).